TCGA&GEO生信高通量数据挖掘分析实战课程

 开班时间: 2021年5月21-23日 (线上/线下)      

课程背景:
2019年度国家自然基金医学科学部共批资助10138项目,批助金额总计441310万元。其中面上项目数量占45%,金额占57%;青年科学基金项目数量占43%,金额占20%。
初步统计,这些项目中大部分都与编码基因有直接或间接的关联。其中,与通路(pathway)关联的有1349项,金额4.89亿;与miRNA相关的有630项,金额2.3亿;与lncRNA相关的有395项,金额1.45亿;
如何获得有创新意义的疾病靶标基因(mRNA,Protein,lncRNA,circRNA,miRNA,Mutation等)是项目申请及文章写作时最常见的问题。基于这个目的,我们开展了该培训班:TCGA&GEO高通量数据挖掘。癌症是临床医学中非常重要的疾病方向。TCGA数据库中包含了常见了40种癌症方向(含30000个样本)的高通量数据及临床信息。大家对TCGA数据库的使用近几年也在逐渐增加!另外,其他疾病的研究可以通过GEO数据库进行。
会议预期: 
通过三天的学习,我们了解生信分析思路对项目及文章的帮助,以及实操常见的数据库、在线工具和本地软件。使得学员可以自己完成一个完整的分析报告并获得疾病相关的靶标基因。
讲师简介:
成果:参与完成了近百篇软件著作权和发明专利的撰写和申请;肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等数据库的分析和构建;完成个体基因检测流程和无创唐筛流程的开发。
研究方向:有近十年的生信分析经验,擅长方向有转录组测序分析、芯片数据分析、疾病机理研究分析、疾病预后与基因关联分析、项目分析思路设计以及个性化分析等,精通perl、R等编程语言。
适合人群:
临床、基础研究等科研领域的各级临床医生、药师、科研单位研究人员、高校硕/博士研究生、对利用单细胞测序或公共数据库研究进行数据挖掘感兴趣的广大师生(尤其适合初学者和无基础的学员,无需任何基础,也无需学习任何编程语言)。
会议日期:  2020年5月21-23日(三天)每天9:00-18:00
会议地点:  线上:腾讯网络会议室;  线下:中兴和泰酒店 上海市浦东新区科苑路866号
线下班为方便上课,推荐入住中兴和泰酒店,主办方协议价 豪华大床/豪华双床 500元/天,高级房 400元/天 含双早。报名时通过主办方预定
会议费用:  线上3200元/人;线下3700元/人。可以开正规会务发票,纸质邀请函(盖红章)。
课程内容:

注意事项: 必须使用win7以上系统的电脑。上课软件为Cytoscape,Heml,GSEA,R和Rstudio。


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参会咨询:

E-mail: kf@yanshudata.com

Mt:13788915181(微信同号)

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